Deciphering the origin of developmental stability: The role of intracellular expression variability in evolutionary conservation
Evolution & Development (2024年3月)
Masato TSUTSUMI, Ph.D.
数理生命動態研究プロジェクト
こんにちは 堤真人（つつみまさと）です。
現在は助教として、筑波大学生存ダイナミクス研究センター数理生命動態研究プロジェクトに在籍し、研究をしております。
兼任として、名古屋大学大学院医学系研究科附属神経疾患・腫瘍分子医学研究センター 細胞情報統合解析部門データ駆動生物学研究室にも在籍しております。
研究内容としては、深層生成モデルを用いた形態の定量化と数理モデルを活用した社会的ストレスの定量化などに取り組んでいます。
興味・関心
- 深層学習を用いた定量化
- 形態計測
- 社会的敗北ストレス
- 定量生物学
経歴
助教, 2025/12 -
筑波大学生存ダイナミクス研究センター
(数理生命動態研究プロジェクト：斉藤稔准教授)客員研究員, 2025/12 -
名古屋大学大学院医学系研究科
(データ駆動生物学分野：本田直樹教授)特任助教, 2024/10 - 2025/11
名古屋大学大学院医学系研究科
(データ駆動生物学分野：本田直樹教授)特任研究員, 2023/10 - 2024/9
広島大学大学院統合生命科学研究科
(データ駆動生物学分野：本田直樹教授)博士 (理学), 2020/4 - 2023/9
東京大学大学院理学系研究科
(指導教員:古澤力教授)修士 (理学), 2018/4 - 2020/4
東京大学大学院理学系研究科
(指導教員:古澤力教授)学士 (理学), 2014/4 - 2018/3
東京大学理学部物理学科
研究分野・関心分野
Deep Learning
VAE, YOLO
Morphometrics
幾何学的形態計測
Biology
定量生物学, EvoDevo
研究業績
3
Papers
27
Presentations
5
Invited Talks
A deep learning approach for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape
npj Systems Biology and Applications (2023年7月6日)
Disentanglement of batch effects and biological signals across conditions in the single-cell transcriptome
bioRxiv (2025年4月16日)
A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape
Preprint (2022年5月19日)
深層学習による生物形態定量解析手法の開発
日本応用数理学会2024年度 年会 (2024年9月16日)
深層学習を用いた生物形態の定量解析手法の開発
シリーズオンラインセミナー「AIが切り開く進化生物学の未来」 (2024年3月9日)
深層学習に基づく生物形態・行動の定量解析: Morpho-VAE と DOLO の開発
共進化表現型創発研究の最前線 〜研究の展開をそのルーツから迫る〜 (2026年2月20日)
深層学習手法を用いた形態や行動などの解析
進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理 (2026年1月13日)
DOLO (Drosophila tracking with YOLO) による2重変異体ハエ幼虫の行動解析
第一回システム行動学研究会 (2025年5月30日)