研究業績

📚 査読付き論文

機械学習・形態解析

2026

  • （更新予定）

2024

  • Deciphering the origin of developmental stability: The role of intracellular expression variability in evolutionary conservation
    Yui Uchida, ○Masato Tsutsumi, Shunsuke Ichii, Naoki Irie, Chikara Furusawa
    Evolution & Development (2024年3月) PDF | Code

2023

  • A deep learning approach for morphological feature extraction based on variational auto-encoder: an application to mandible shape
    ○Masato Tsutsumi, Nen Saito, Daisuke Koyabu, Chikara Furusawa
    npj Systems Biology and Applications (2023年7月6日) PDF | Code

📃 プレプリント

2026

  • （更新予定）

2025

  • Disentanglement of batch effects and biological signals across conditions in the single-cell transcriptome
    Shunta Sakaguchi, ○Masato Tsutsumi, Kentaro Nishi, Naoki Honda
    bioRxiv (2025年4月16日) PDF

2022

  • A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder : an application to mandible shape
    ○Masato Tsutsumi, Nen Saito, Daisuke Koyabu, Chikara Furusawa
    Preprint (2022年5月19日)

🎤 招待講演

2026

  • 「多様な生命現象の定量化に向けて：情報として読む形態・行動・心理」 ＠SSTB2026 -Spring School for Theoretical Biology 2026- (2026年3月5日) 招待有り

2024

  • 「深層学習による生物形態定量解析手法の開発」 ＠日本応用数理学会2024年度 年会 (2024年9月16日)
  • 「深層学習を用いた生物形態の定量解析手法の開発」 ＠シリーズオンラインセミナー「AIが切り開く進化生物学の未来」 (2024年3月9日)
  • 「深層学習を用いた生物形態の定量解析手法の開発」 ＠第8回理論免疫学ワークショップ (2024年2月14日)

2022

  • 「機械学習を用いた様々な生物形態の定量化」 ＠広島大学数理生命科学プログラムセミナー (2022年11月10日)

2021

  • 「機械学習を用いた生物形態の定量化とその応用について 霊長目の下顎骨を対象として」＠基礎生物学研究所部門セミナー (2021年10月)

🗣️ 学会発表

2026

  • 「深層学習に基づく生物形態・行動の定量解析: Morpho-VAE と DOLO の開発」＠共進化表現型創発研究の最前線 〜研究の展開をそのルーツから迫る〜 (2026年2月20日)
  • 「深層学習手法を用いた形態や行動などの解析」＠進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理 (2026年1月13日)

2025

  • 「Development of a markerless multi-individual tracking system for controlling cannibalistic behavior in crickets」＠日本比較生理生化学会 第47回大会 (2025年12月5日)
  • 「深層学習を用いた形態定量化手法: Morpho-VAE」＠第99回形の科学シンポジウム「動きをもたらすかたち」 (2025年11月30日)
  • 「3次元Variational Autoencoderを用いた形態変異の可視化」＠第34回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 「DOLO(Drosophila tracking with YOLO)による2重変異体ハエ幼虫の行動解析」＠第一回システム行動学研究会 (2025年5月30日)
  • 「エネルギーランドスケープ解析による緊急事態宣言中/後における心理状態遷移の推定」＠SSTB2025 -Spring School for Theoretical Biology 2025-* (2025年2月20日)

2024

  • 「深層学習による形態定量解析手法の提案」＠2024年度日本数理生物学会年会 (2024年9月12日)
  • 「数理モデルを用いた社会的敗北ストレス下でのマウス行動の定量化」＠CPSY TOKYO 2024 (2024年3月28日)
  • 「ベイズ推論を用いた脳内反芻思考の数理モデル」＠理論生物学スプリングスクール2024 (2024年2月20日)
  • 「自由エネルギー原理を用いた脳内反芻思考の数理モデル」＠定量生物学の会 第十一回年会 (2024年1月6日)

2023

  • 「Unveiling the enigmatic Middle Devonian vertebrate, Palaeospondylus」＠The 3rd Asia Evo Conference Symposium (2023年12月16日)
  • 「Development of a quantitative analysis method for biological morphology using deep learning」＠Statphys28 Satellite meeting Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems (2023年8月8日)

2022

  • 「変分オートエンコーダを用いた霊長目の下顎形態特徴量抽出」＠定量生物学の会第十回年会 (2022年12月15日)
  • 「A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder」＠第60回日本生物物理学会年会 (2022年9月30日)
  • 「A Deep learning approach for the shape analysis of the primates mandible」＠Euro Evo Devo 2022 (2022年6月1日)

📝 その他の業績

  • 「機械学習を用いた生物形態の定量化」
    応用物理学会 (2020)