研究業績
📚 査読付き論文
機械学習・形態解析
2026
- Disentanglement of batch effects and biological signals across conditions in the single-cell transcriptome
Shunta Sakaguchi#, ○Masato Tsutsumi#（共第一著者）, Kentaro Nishi, Naoki Honda
Patterns (in press; 2026年10月掲載予定) DOI - Artificial-Intelligence-Based Cephalometric Landmark Detection in Lateral Cephalograms
Manami Yamaguchi, ○Masato Tsutsumi, Yasuhiro Kuroda, Yoshiki Soeda, Tetsutaro Yamaguchi
Journal of Clinical Medicine (2026年7月30日) PDF | DOI
2024
- Deciphering the origin of developmental stability: The role of intracellular expression variability in evolutionary conservation
Yui Uchida, ○Masato Tsutsumi, Shunsuke Ichii, Naoki Irie, Chikara Furusawa
Evolution & Development (2024年3月) PDF | Code
2023
📃 プレプリント
2026
- Mind the gap: quantifying population–individual gap in depressive symptom dynamics through energy landscapes
○Masato Tsutsumi, Taisei Kubo, Takahiro A. Kato, Naoki Honda
bioRxiv (2026年5月24日; v2) PDF | DOI - Chemosensory input suppresses cannibalism by stabilizing social feeding boundaries in Drosophila larvae
Nagisa Matsuda-Watanabe, ○Masato Tsutsumi, Misako Okumura, Takahiro Chihara
投稿中 - Decoding Anadara shell morphology with deep learning
○Masato Tsutsumi, Nen Saito, Tomohiro Yamaguchi, Takenori Sasaki, Chikara Furusawa
bioRxiv (2026年4月21日) PDF | DOI
🎤 招待講演
2026
- 「生き物のかたちの違いを測るAI」 ＠令和８年度筑波大学公開講座 生命学際研究の最前線２０２６ (2026年7月30日) 招待有り
- 「情報科学を用いたかたちの定量化に向けて」 ＠「かたち」の定量ワークショップ 2026 (2026年7月27日) 招待有り
- 「情報科学的アプローチによる生物形態の定量化手法の開発」 ＠第78回日本細胞生物学会大会 (2026年7月15日) 招待有り
- 「変分エネルギーランドスケープ解析が明らかにするCOVID-19緊急事態宣言中およびその後の集団的傾向と個人的異質性」 ＠2026年度 人工知能学会全国大会（第40回） (2026年6月9日) 招待有り
- 「多様な生命現象の定量化に向けて：情報として読む形態・行動・心理」 ＠SSTB2026 -Spring School for Theoretical Biology 2026- (2026年3月5日) 招待有り
2024
- 「深層学習による生物形態定量解析手法の開発」 ＠日本応用数理学会2024年度 年会 (2024年9月16日)
- 「深層学習を用いた生物形態の定量解析手法の開発」 ＠シリーズオンラインセミナー「AIが切り開く進化生物学の未来」 (2024年3月9日)
- 「深層学習を用いた生物形態の定量解析手法の開発」 ＠第8回理論免疫学ワークショップ (2024年2月14日)
2022
- 「機械学習を用いた様々な生物形態の定量化」 ＠広島大学数理生命科学プログラムセミナー (2022年11月10日)
2021
- 「機械学習を用いた生物形態の定量化とその応用について 霊長目の下顎骨を対象として」＠基礎生物学研究所部門セミナー (2021年10月)
🗣️ 学会発表
2026
- 「Mind the gap: エネルギーランドスケープを用いた抑うつ症状動態における集団-個人間の差異の定量化」＠第二回システム行動学研究会 (2026年7月12日)
- 「系統解析における機械学習を用いた形態形質選抜：鱗竜類の系統位置の再検討」＠日本古生物学会 2026年年会・総会 (2026年6月27日)
- 「深層学習に基づく生物形態・行動の定量解析: Morpho-VAE と DOLO の開発」＠共進化表現型創発研究の最前線 〜研究の展開をそのルーツから迫る〜 (2026年2月20日)
- 「深層学習手法を用いた形態や行動などの解析」＠進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理 (2026年1月13日)
2025
- 「Development of a markerless multi-individual tracking system for controlling cannibalistic behavior in crickets」＠日本比較生理生化学会 第47回大会 (2025年12月5日)
- 「深層学習を用いた形態定量化手法: Morpho-VAE」＠第99回形の科学シンポジウム「動きをもたらすかたち」 (2025年11月30日)
- 「3次元Variational Autoencoderを用いた形態変異の可視化」＠第34回日本バイオイメージング学会学術集会
- 「DOLO(Drosophila tracking with YOLO)による2重変異体ハエ幼虫の行動解析」＠第一回システム行動学研究会 (2025年5月30日)
- 「エネルギーランドスケープ解析による緊急事態宣言中/後における心理状態遷移の推定」＠SSTB2025 -Spring School for Theoretical Biology 2025-* (2025年2月20日)
2024
- 「深層学習による形態定量解析手法の提案」＠2024年度日本数理生物学会年会 (2024年9月12日)
- 「数理モデルを用いた社会的敗北ストレス下でのマウス行動の定量化」＠CPSY TOKYO 2024 (2024年3月28日)
- 「ベイズ推論を用いた脳内反芻思考の数理モデル」＠理論生物学スプリングスクール2024 (2024年2月20日)
- 「自由エネルギー原理を用いた脳内反芻思考の数理モデル」＠定量生物学の会 第十一回年会 (2024年1月6日)
2023
- 「Unveiling the enigmatic Middle Devonian vertebrate, Palaeospondylus」＠The 3rd Asia Evo Conference Symposium (2023年12月16日)
- 「Development of a quantitative analysis method for biological morphology using deep learning」＠Statphys28 Satellite meeting Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems (2023年8月8日)
2022
- 「変分オートエンコーダを用いた霊長目の下顎形態特徴量抽出」＠定量生物学の会第十回年会 (2022年12月15日)
- 「A method for morphological feature extraction based on variational auto-encoder」＠第60回日本生物物理学会年会 (2022年9月30日)
- 「A Deep learning approach for the shape analysis of the primates mandible」＠Euro Evo Devo 2022 (2022年6月1日)
📝 その他の業績
- 「機械学習を用いた生物形態の定量化」
応用物理学会 (2020)